本院設立於民國84年8月,名為「人文社會科學學院」,乃整合「人文學」與「社會科學」兩個領域為一個學院。民國97年8月起,因應與花蓮教育大學整併,本院亦與原花蓮教育大學人文社會學院合併,院屬系所中心跨校本部與美崙校區。目前校本部設有中國語文學系(學士班、碩士班、博士班皆備);英美語文學系學士班、 比較文學博士班;創作與英語文學研究所碩士班;歷史學系學士班、碩士班;經濟學系(學士班、碩士班;博士班皆備);諮商與臨床心理學系學士班、碩士班;公共行政研究所碩士班 、碩士在職專班;財經法律研究所碩士班,以及數位文化、大陸研究、歐盟研究三個中心。美崙校區則設有中國語文學系學士班、碩士班;英語學系學士班、碩士班;鄉土文化學系學士班、碩士班;臺灣語文學系學士班;民間文學研究所碩士班、博士班;社會發展學系學士班、碩士班,以及台灣文史資源中心。

人文社會科學學院(校本部部分)座落於本校校本部文學院大樓。文學院大樓介於行政大樓及共同教學大樓之間,為一四層樓建築。建築本身相當具中國風情,瓦頂與四樓紅色長廊為一大特色,中庭以月洞門及八角亭為主要造景,搭配知名石雕家之三件石雕作品,相映成趣。除中庭外,正門花壇處亦安置兩尊石雕作品,營造優雅而富含人文氣息的教學環境。

文學院大樓的總面積共計14246.28平方公尺,其中第一、二層樓主要供教學使用,第三層樓為各單位辦公室,第四層樓主要為教授研究室。由於師生員額規模不斷擴大,現有建物空間已不敷使用,部分教授的研究室不得不安排至本校其他的大樓中。